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迈杰转化医学研究(苏州)有限公司

NGS平台

NGS平台

平台介绍  

  • 迈杰转化医学NGS平台现有Illumina NovaSeq 6000、NextSeq500、Miniseq测序仪及Qiagen Genereader等一站式临床诊断测序平台,目前已建立的常规检测能力包括MRD检测、WGS全基因组测序、WES全外显子组测序、mRNA-Seq、lncRNA-Seq、miRNA-Seq、mNGS病原微生物检测、靶向富集测序、单细胞基因组/转录组测序、宏基因组测序、免疫组库测序、慢病毒插入位点检测等。平台多次满分通过国家卫生部临检中心(NCCL)及美国病理学家协会(CAP)组织的室间质评与能力认证;已完成20+方法学开发与验证,支持40多个临床实验,完成了数千例余例样本的检测。

NGS平台设备

能力展示  

NGS平台能力

Med1CDx :用于实体肿瘤检测的综合性测序产品

Med1CDx

HEMECDx:血液恶性疾病综合测序产品

HEMECDx

OncoCDx:指导靶向治疗、化疗等用药的综合性测序产品

  • OncoCDx Panel是迈杰转化医学自主开发的泛实体瘤中Panel产品,采用探针杂交捕获(Probe-Based Hybridization Capture)和下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS)技术进行检测,可检测点突变、插入/缺失、拷贝数变异、融合/重排等多种突变类型。基于临床检测需求,为患者提供一个高性价比的肿瘤用药其因检测方案,满足患者靶药、化药、免疫药用药指导需求。

OncoCDx

单细胞测序平台  

  • Chromium单细胞基因表达

    数万个单细胞的基因表达分析
    鉴定罕见的细胞类型
    绘制和描述复杂的细胞群体
    了解细胞异质性
    发现新的生物标志物

    捕获原理:捕获并扩增3‘mRNA

  • Chromium单细胞免疫分析

    数万个T细胞和B细胞的全长配对受体测序和基因表达谱分析。

    分析免疫细胞组库
    确定B细胞和T细胞的抗原特异性
    表征组织微环境

    捕获原理:捕获并扩增5‘mRNA/对全长BCR/TCR基因进行捕获并测序

  • Chromium单细胞ATAC

    染色质转座酶可接近性分析(ATAC),实现数万个单细胞核的表观基因组分析

    定义细胞类型和细胞状态
    收录细胞类型特异性的调控因子
    鉴定重要的转录因子
    绘制基因调控网络

    捕获原理:
    细胞核经转座酶处理
    对转座酶可接近的DNA片段进行捕获和扩增

  • Chromium单细胞多组学ATAC+基因表达

    同时分析数万个细胞的同一细胞内基因表达和开放染色质
    关联调控元件和目标基因
    表征细胞异质性
    发现新的基因调控相互作用
    鉴定罕见的细胞类型

    捕获原理:
    经过转座酶处理的细胞核
    对转座酶可接近的DNA片段进行捕获和扩增
    捕获并扩增3’mRNA