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迈杰转化医学研究(苏州)有限公司

技术进展
杰论系列 | 成纤维细胞生长因子受体(FGFR)临床意义及检测
来源: 时间:2024-06-20


一、FGFR简介  



FGFR,全称是成纤维细胞生长因子受体(Fibroblast Growth Factor Receptor),与EGFR同属于受体酪氨酸激酶(RTKs)家族。FGFR家族 至少有28个不同的成员,主要分布于上皮或内皮细胞 主要包括 FGFR1、FGFR2、FGFR3和FGFR4 四种亚型,各亚型均具有与配体结合的胞外区、跨膜区和受体磷酸化的胞内区的结构特点。FGFR分子改变可导致异常FGF/FGFR信号,促使细胞增殖、新血管生成、侵袭、转移、抗凋亡等,这与广泛的人类恶性肿瘤有关。


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图1:FGFR信号和抑制剂相互作用触发下游信号网络,包括Ras-Raf-MAPK、PI3K-AKT、PLCγ和STATs通路,导致一系列细胞反应,包括增殖、分化、生存、迁移和血管生成 [4 ]

二、
FGFR临床意义(FGFR与肿瘤)

在一项12372例超过20种肿瘤类型的中国癌症患者(60%为男性)队列研究中,分别有895例(7.2%)、862例(7.0%)和186例(1.5%)患者的FGF、FGFR和两者的基因组改变。FGF/FGFR突变发生率最高的是食道癌(61.6%,98/159)和尿路癌(52.7%,145/275)。最常见的途径水平突变是FGFR单核苷酸变异(5.1%)和FGF扩增(5.1%)。微卫星不稳定状态与扩增结果呈负相关(p=0.0017)。


其中,SNVs患者1032例(8.3%),扩增患者930例(7.5%),FGF/FGFR基因融合患者116例(0.9%)。在每种肿瘤类型中,FGF和FGFR的变异频率大多具有可比性。当按突变类型分层时,最常见的通路水平FGFR基因SNVs( 5.1%)、FGF基因扩增(5.1%)和FGFR基因扩增(2.9%)的异常均有所下降。最常见的基因水平改变是FGF19(3.7%)、FGF4(3.7%)、FGF3( 3.5%)和FGFR1(1.8%)的扩增,其次是FGFR2(1.8%)、FGFR3(1.7%)、FGFR4( 1.2%)和FGFR1(1.2%)的SNV。


近年来,不少研究表明,FGFR的高表达、突变会导致其下游信号通路异常激活,促使细胞增殖、上皮间质转化和血管生成以及肿瘤细胞的侵袭、转移和对治疗的耐受,以上这些因素共同作用于肿瘤微环境,最终触发不良预后,因此FGFR家族一直以来都是肿瘤免疫靶向治疗的研究重点和热点。

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图2:癌症患者的FGF/FGFR基因 。(A)不同癌症类型中FGF/FGFR变异类型;(B)突变基因在FGF/FGFR中的分布。(C)不同基因突变之间的互斥性和共现关系;(D)不同通路基因变异 [2 ]


三、
FGFR抑制剂研究进展

国内外获批上市的FGFR药物进展


截至目前,国内外已经有多款FGFR抑制剂上市,用于治疗不同的晚期FGFR家族基因变异的实体瘤患者。 FGFR选择性TKIs分为三类: 第一类是pan-FGFR抑制剂,可同时有效抑制FGFR1~4; 第二类是FGFR1~3抑制剂,可有效抑制FGFR1~3,对FGFR4抑制作用微弱; 第三类是FGFR4抑制剂,对FGFR1~3的选择性较弱。


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表1:国内外获批上市的FGFR药物进展


四、 FGFR基因变异的检测在肿瘤治疗中的意义


指南推荐检测FGFR

1、尿路上皮癌

中国临床肿瘤协会(CSCO)尿路上皮癌2023版最新指南中,推荐使用靶向及免疫治疗疗效预判等分子检测,指出FGFR3突变可用于尿路上皮癌的早期诊断和术后复发,也推荐厄达替尼用于合并FGFR2/3基因变异的转移性尿路上皮癌的二线治疗和三线治疗,均为2A类推荐。

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图3~6:尿路上皮癌病理诊断及二线治疗策略推荐 [6 ]

2、胆道恶性肿瘤
中国临床肿瘤协会(CSCO)胆道恶性肿瘤2023版最新指南指出,在胆管癌的病理诊断中,推荐加测FGFR2断裂探针FISH检测和IDH1/2一代测序,或者进行二代测序检测。

在晚期胆道恶性肿瘤的一线治疗中,推荐符合精准用药条件的所有胆道肿瘤患者参加临床研究,包括但不限于FGFR2融合突变、IDH1/2突变、POLE/POLD突变、BRCA突变/BAP突变/ATM突变、BRAF突变等。在二线治疗中,FGFR2融合/重排肿瘤的药物治疗也归入了III级推荐。

3、胃癌

中国临床肿瘤协会(CSCO)胃癌2024版最新指南中,对于标准治疗失败的晚期或者胃癌复发患者,为了寻找潜在的治疗靶点,可进行FGFR2、c-MET等标志物检测。

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图7:胃癌分子诊断推荐 [7 ]

五、迈杰 FGFR分子诊断策略


1、 pan FGFxCDx panel

(1) 预期用途(panel简介):
panFGFx panel包含40个基因的检测:1)FGFR上游配体基因FGFs共16个基因;2)FGFR1-4基因;3)FGFR基因下游的信号通路基因。


通过对FGFR1-4基因不同变异类型检测,可覆盖多种肿瘤,如扩增主要见于乳腺癌、胃癌及肺癌;获得性功能突变主要见于乳腺癌、子宫内膜癌、肉瘤及肺癌等;基因融合可见于膀胱癌、胆管癌、恶性胶质瘤及肺癌等,而配体基因的变异情况往往也是FGFR抑制剂药物的一个重要关注点。


FGFR下游信号通路基因,如AKTs、MAPK等,这些基因也被报道在多种肿瘤中发生突变,如黑色素瘤、非小细胞肺癌、肾细胞癌等,并且已有对应的药物获批;在TKI药物研发过程中,同时监测下游信号通路基因必不可少。


迈杰的panFGFx panel产品预期用途为FGFR抑制剂的入组筛查检测。


(2)   产品优势:

1. 针对性强:针对FGFR抑制剂TKI药物研究定制panel,集中研究FGFR及上下游信号通路关键基因;完美实现药企“小而精”的需求;
2. 应用范围广:panel小,成本低;搭配酶切建库法、快速杂交法,缩短TAT;
3. 灵活性强:探针可物理上实现模块区分,可考虑部分模块发展为IVD产品;
4. 聚焦新型生物标志物FGFR检测: FGFR1-4基因探针覆盖全部外显子,包括UTR区,覆盖最全;针对融合检测,加入了已知融合伙伴的部分探针,提高融合检出率。

(3)   送样要求:
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2、MiniCDx 2.0 panel


(1)预期用途(panel简介):

MiniCDx 2.0泛实体瘤基因检测方案,涵盖153个临床意义明确的基因标志物,可提供靶向治疗(尤其ADC治疗)、免疫治疗、化疗以及肿瘤遗传相关信息。如体细胞突变(点突变、短插入缺失、拷贝数增加或缺失、结构变异如融合)、胚系遗传筛查、MSI和化疗位点的检测信息。 适用于肺癌、结直肠癌、胃癌、肝胆肿瘤、胰腺癌、胃肠间质瘤、乳腺癌、甲状腺癌、前列腺癌、肾癌、尿路上皮癌、头颈癌、胶质瘤及黑色素瘤等泛实体瘤患者的诊断、预测、预后及遗传相关基因的检测。


(2)产品优势:

1. 面向泛实体瘤患者,可覆盖FGFR通路基因及多个下游通路基因;

2. 聚焦临床可干预性变异,检出皆有意义;

3. 可预测ADC药物疗效,丰富个体化诊疗信息;

4. 加入UMIs接头,提高低频突变检测准确性;

5. 液态活检突变频率可低至0.1%。


(3)送样要求:

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参考文献


[1] 邱田,陈旭,林天歆,等.FGFR基因变异及FGFR受体抑制剂的研究进展[J].中国肿瘤, 2023, 32(4):312-320.
[2] Zuo W , He Y , Li W ,et al.Landscape of FGF/FGFR alterations in 12,372 chinese cancer patients[J].Journal of Cancer, 2020, 11(22):6695-6699.DOI:10.7150/jca.49269.
[3] Sleeman M , Fraser J , Mcdonald M ,et al.Identification of a new fibroblast growth factor receptor, FGFR5[J].Gene, 2001, 271(2):171-182.DOI:10.1016/S0378-1119(01)00518-2.
[4] Zhang P, Yue L, Leng Q, Chang C, Gan C, Ye T, Cao D. Targeting FGFR for cancer therapy. J Hematol Oncol. 2024 Jun 3;17(1):39. doi: 10.1186/s13045-024-01558-1. PMID: 38831455; PMCID: PMC11149307.

[5] 中国临床研究肿瘤学会(CSCO)胆道恶性肿瘤诊疗指南2023.

[6] 中国临床研究肿瘤学会(CSCO)尿路上皮癌诊疗指南2023.

[7] 中国临床研究肿瘤学会(CSCO)胃癌诊疗指南2024.

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